CPSF1 - CPSF1

CPSF1
Tanımlayıcılar
Takma adlar	CPSF1, CPSF160, HSU37012, P / cl.18, bölünme ve poliadenilasyon spesifik faktör 1
Harici kimlikler	OMIM: 606027 MGI: 2679722 HomoloGene: 40865 GeneCard'lar: CPSF1
Gen konumu (İnsan)
Chr.	Kromozom 8 (insan)
Son	144,409,349 bp
Gen konumu (Fare)
Chr.	Kromozom 15 (fare)
Son	76,607,591 bp
RNA ifadesi Desen
	; ; ; ;
	Daha fazla referans ifade verisi
Gen ontolojisi
Moleküler fonksiyon	• nükleik asit bağlanması; • enzim bağlama; • GO: 0001948 protein bağlama; • mRNA 3'-UTR AU açısından zengin bölge bağlanması; • RNA bağlanması;
Hücresel bileşen	• mRNA bölünmesi ve poliadenilasyon özgüllük faktör kompleksi; • hücre çekirdeği; • nükleoplazma;
Biyolojik süreç	• spliceozom yoluyla mRNA ekleme; • RNA polimeraz II transkripsiyonunun sonlandırılması; • mRNA poliadenilasyon; • mRNA işleme; • mRNA bölünmesi; • mRNA 3'-uç işleme; • Çekirdekten mRNA ihracatı; • poliadenilasyon için gerekli mRNA öncesi bölünme; • endonükleolitik bölünme ve ligasyon yoluyla tRNA ekleme;
	Kaynaklar:Amigo / QuickGO
Ortologlar
	29894
	94230
	ENSG00000071894
	ENSMUSG00000034022
	Q10570
	Q9EPU4
	NM_013291
	NM_001164173; NM_053193; NM_001361485
	NP_037423
	NP_001157645; NP_444423; NP_001348414
	Vikiveri
İnsanı Görüntüle / Düzenle	Fareyi Görüntüle / Düzenle

Bölünme ve poliadenilasyon özgüllük faktörü alt birimi 1 bir protein insanlarda kodlanır CPSF1 gen.^[5]^[6]^[7]

Çoğu durumda ökaryotik ön haberci (m) RNA 3 ana uç, iki koordineli adımda işlenir. İlk önce bir endonükleaz tarafından bölgeye özgü bir bölünme ve ardından 5 üssü bölünme ürününün 3 ana ucuna bir poli (A) kuyruğun eklenmesi vardır. Bölünme, tek bir alt birim poli (A) polimeraz (PAP) ile birlikte dört çoklu alt birim kompleksi, yani bölünme ve poliadenilasyon özgüllük faktörü (CPSF), bölünme uyarma faktörü (CstF), bölünme faktörleri Im ve IIm (CFIm ve CFIIm) gerektirir. CPSF1, CPSF1, CPSF2, CPSF3, CPSF4, FIP1L1, Symplekin ve WDR33'ten oluşan ve çekirdekte bulunan CPSF kompleksinin en büyük bileşenidir.^[8]

Referanslar

^ ^a ^b ^c GRCh38: Ensembl sürümü 89: ENSG00000071894 - Topluluk, Mayıs 2017
^ ^a ^b ^c GRCm38: Ensembl sürüm 89: ENSMUSG00000034022 - Topluluk, Mayıs 2017
^ "İnsan PubMed Referansı:". Ulusal Biyoteknoloji Bilgi Merkezi, ABD Ulusal Tıp Kütüphanesi.
^ "Mouse PubMed Referansı:". Ulusal Biyoteknoloji Bilgi Merkezi, ABD Ulusal Tıp Kütüphanesi.
^ Jenny A, Keller W (Eylül 1995). "Sığır klevaj ve poliadenilasyon özgüllük faktörünün 160 kDa alt birimini kodlayan cDNA'ların klonlanması". Nükleik Asitler Res. 23 (14): 2629–35. doi:10.1093 / nar / 23.14.2629. PMC 307085. PMID 7651824.
^ Murthy KG, Manley JL (Aralık 1995). "İnsan bölünme-poliadenilasyon özgüllük faktörünün 160-kD alt birimi, ön-mRNA 3'-uç oluşumunu koordine eder". Genes Dev. 9 (21): 2672–83. doi:10.1101 / gad.9.21.2672. PMID 7590244.
^ "Entrez Geni: CPSF1 bölünmesi ve poliadenilasyona özgü faktör 1, 160kDa".
^ Shi Y, Di Giammartino DC, Taylor D, Sarkeshik A, Rice WJ, Yates JR, Frank J, Manley JL (Şubat 2009). "İnsan pre-mRNA 3 'işleme kompleksinin moleküler mimarisi". Mol. Hücre. 33 (3): 365–76. doi:10.1016 / j.molcel.2008.12.028. PMC 2946185. PMID 19217410.

daha fazla okuma

Keller W, Bienroth S, Lang KM, Christofori G (1992). "Bölünme ve poliadenilasyon faktörü CPF özellikle ön mRNA 3 'işleme sinyali AAUAAA ile etkileşir". EMBO J. 10 (13): 4241–9. doi:10.1002 / j.1460-2075.1991.tb05002.x. PMC 453176. PMID 1756731.
Thuresson AC, Aström J, Aström A, vd. (1994). "İnsan hücrelerinde çoklu poli (A) polimeraz formları". Proc. Natl. Acad. Sci. AMERİKA BİRLEŞİK DEVLETLERİ. 91 (3): 979–83. doi:10.1073 / pnas.91.3.979. PMC 521437. PMID 8302877.
Schul W, Groenhout B, Koberna K, vd. (1996). "RNA 3 'yarılma faktörleri CstF 64 kDa ve CPSF 100 kDa, sarmal cisimler ve yeni sentezlenen RNA ile yakından ilişkili nükleer alanlarda yoğunlaşmıştır". EMBO J. 15 (11): 2883–92. doi:10.1002 / j.1460-2075.1996.tb00649.x. PMC 450226. PMID 8654386.
McCracken S, Fong N, Yankulov K, vd. (1997). "RNA polimeraz II'nin C-terminal alanı, mRNA işlemesini transkripsiyonla birleştirir". Doğa. 385 (6614): 357–61. doi:10.1038 / 385357a0. PMID 9002523. S2CID 4307073.
Dantonel JC, Murthy KG, Manley JL, Tora L (1997). "Transkripsiyon faktörü TFIID, mRNA'nın 3 'ucunun oluşumu için faktör CPSF'yi görevlendirir". Doğa. 389 (6649): 399–402. doi:10.1038/38763. PMID 9311784. S2CID 4413324.
Takagaki Y, Manley JL (2000). "İnsan Poliadenilasyon Makinaları İçindeki Kompleks Protein Etkileşimleri Yeni Bir Bileşeni Tanımlıyor". Mol. Hücre. Biol. 20 (5): 1515–25. doi:10.1128 / MCB.20.5.1515-1525.2000. PMC 85326. PMID 10669729.
de Vries H, Rüegsegger U, Hübner W, vd. (2000). "İnsan pre-mRNA bölünme faktörü IIm, maya proteinlerinin homologlarını içerir ve diğer iki bölünme faktörünü birbirine bağlar". EMBO J. 19 (21): 5895–904. doi:10.1093 / emboj / 19.21.5895. PMC 305781. PMID 11060040.
Samiotaki M, Balatsos NA, Courtis N, Tsiapalis CM (2001). "160-kDa bölünme ve poliadenilasyon özgüllük faktörünün (CPSF1) alt biriminin radyasyon hibrit haritalama ile insan kromozomu 8q24.23'e atanması". Cytogenet. Hücre Geneti. 90 (3–4): 234–5. doi:10.1159/000056776. PMID 11124521. S2CID 202645825.
McCracken S, Lambermon M, Blencowe BJ (2002). "SRm160 Splicing Coactivator, Transkript 3′-End Bölünmesini Teşvik Ediyor". Mol. Hücre. Biol. 22 (1): 148–60. doi:10.1128 / MCB.22.1.148-160.2002. PMC 134228. PMID 11739730.
Maeda Y, Ito M, Harashima N, vd. (2002). "Bölünme ve poliadenilasyon özgüllük faktöründen (CPSF) türetilmiş peptitler, gastrointestinal kanser hastalarının çoğunda HLA-A2 ile sınırlı ve tümöre özgü CTL'leri indükleyebilir". Int. J. Kanser. 99 (3): 409–17. doi:10.1002 / ijc.10377. PMID 11992410. S2CID 12789683.
Holland L, Gauthier L, Bell-Rogers P, Yankulov K (2002). "Minikromozom idame proteini 2'nin farklı parçaları, histon H3 / H4 ve RNA polimeraz II holoenzim ile ilişkilidir". Avro. J. Biochem. 269 (21): 5192–202. doi:10.1046 / j.1432-1033.2002.03224.x. PMID 12392551.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, vd. (2003). "15.000'den fazla tam uzunlukta insan ve fare cDNA dizisinin üretimi ve ilk analizi". Proc. Natl. Acad. Sci. AMERİKA BİRLEŞİK DEVLETLERİ. 99 (26): 16899–903. doi:10.1073 / pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
Lehner B, Semple JI, Brown SE, vd. (2004). "Yüksek verimli bir maya iki hibrit sisteminin analizi ve bunun, insan MHC sınıf III bölgesinde kodlanmış hücre içi proteinlerin işlevini tahmin etmek için kullanımı". Genomik. 83 (1): 153–67. doi:10.1016 / S0888-7543 (03) 00235-0. PMID 14667819.
Kaufmann I, Martin G, Friedlein A, vd. (2005). "İnsan Fip1, U bakımından zengin RNA elemanlarına bağlanan ve poli (A) polimerazı uyaran bir CPSF alt birimidir". EMBO J. 23 (3): 616–26. doi:10.1038 / sj.emboj.7600070. PMC 1271804. PMID 14749727.
Beausoleil SA, Jedrychowski M, Schwartz D, vd. (2004). "HeLa hücresi nükleer fosfoproteinlerinin büyük ölçekli karakterizasyonu". Proc. Natl. Acad. Sci. AMERİKA BİRLEŞİK DEVLETLERİ. 101 (33): 12130–5. doi:10.1073 / pnas.0404720101. PMC 514446. PMID 15302935.
Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA ve diğerleri. (2004). "NIH Tam Boy cDNA Projesinin Durumu, Kalitesi ve Genişlemesi: Memeli Gen Koleksiyonu (MGC)". Genom Res. 14 (10B): 2121–7. doi:10.1101 / gr.2596504. PMC 528928. PMID 15489334.

Dış bağlantılar

İnsan CPSF1 genom konumu ve CPSF1 gen ayrıntıları sayfası UCSC Genom Tarayıcısı.

Bu makale bir gen açık insan kromozomu 8 bir Taslak. Wikipedia'ya şu yolla yardım edebilirsiniz: genişletmek.

[refGRCh38Ensembl-1] GRCh38: Ensembl sürümü 89: ENSG00000071894 - Topluluk, Mayıs 2017

[refGRCm38Ensembl-2] GRCm38: Ensembl sürüm 89: ENSMUSG00000034022 - Topluluk, Mayıs 2017

[3] "İnsan PubMed Referansı:". Ulusal Biyoteknoloji Bilgi Merkezi, ABD Ulusal Tıp Kütüphanesi.

[4] "Mouse PubMed Referansı:". Ulusal Biyoteknoloji Bilgi Merkezi, ABD Ulusal Tıp Kütüphanesi.

[pmid7651824-5] Jenny A, Keller W (Eylül 1995). "Sığır klevaj ve poliadenilasyon özgüllük faktörünün 160 kDa alt birimini kodlayan cDNA'ların klonlanması". Nükleik Asitler Res. 23 (14): 2629–35. doi:10.1093 / nar / 23.14.2629. PMC 307085. PMID 7651824.

[pmid7590244-6] Murthy KG, Manley JL (Aralık 1995). "İnsan bölünme-poliadenilasyon özgüllük faktörünün 160-kD alt birimi, ön-mRNA 3'-uç oluşumunu koordine eder". Genes Dev. 9 (21): 2672–83. doi:10.1101 / gad.9.21.2672. PMID 7590244.

[entrez-7] "Entrez Geni: CPSF1 bölünmesi ve poliadenilasyona özgü faktör 1, 160kDa".

[pmid19217410-8] Shi Y, Di Giammartino DC, Taylor D, Sarkeshik A, Rice WJ, Yates JR, Frank J, Manley JL (Şubat 2009). "İnsan pre-mRNA 3 'işleme kompleksinin moleküler mimarisi". Mol. Hücre. 33 (3): 365–76. doi:10.1016 / j.molcel.2008.12.028. PMC 2946185. PMID 19217410.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]