Haplogrup M18 - Haplogroup M18

Haplogrup M18
Muhtemel menşe zamanı17.100 ± 4.700 ybp (Metspalu),[1] 20,800 ± 8,900 ybp (Thangaraj) [2]
Olası menşe yeriHindistan / Güney Asya
AtaM4'30
Mutasyonları tanımlama12498 ve 15942 (kodlama bölgesi) ve 194 (kontrol bölgesi)

İçinde insan mitokondriyal genetiği, haplogroup M18 bir insan mitokondriyal DNA (mtDNA) haplogrubu. Hindistan'a özgü bir soydur.[1][2][3]

Menşei

M18, makronun soyundan gelir.Haplogrup M (mtDNA) ve antik Hint'e özgü bir M.[1][3] Haplogroup M18, M4 ile birlikte ortak bir kodlama bölgesi mutasyonunu (12007) paylaşır, M30, M37 ve M38 haplogrupları haplogroup M (süperhaplogrup M4'30).[2][3][4] M4′30 süper kuşak, 2 haplogrup arasında bir ara soyu paylaşan tek klad iken, tüm M soylarının geri kalanı, makrohaplogrup M'nin kökünden bağımsız olarak ortaya çıkmıştır; böylece hızlı dağılma fikrini destekler modern insanlar boyunca Asya onlar gittikten sonra sahil Afrika ardından uzun bir tecrit dönemi izledi.[3]

Tam mtDNA dizilerinden daha fazla bilgi bekleyen haplogrup M18, ilk olarak Metspalu ve diğerleri tarafından 2004 yılında np 16318'de transversiyon kullanılarak tanımlandı.[1] Bu daha sonra 2006 yılında Thangaraj ve diğerleri tarafından revize edildi.[2] Şu anda, haplogrup, iki kodlama bölgesi mutasyonu, 12498 ve 15942 ve ek bir kontrol bölgesi mutasyonu 194 ile karakterize edilmektedir.[2]

Dağıtım

Metspalu ve arkadaşlarının 2004 yılında yaptığı bir çalışma, 796 Hintli, 436 İranlı örneklerinde mtDNA varyasyonunu analiz etti ve bunları Avrupa, Çin ve Tayland'daki örneklerde karşılaştırdı. Çalışma, M18'in güneydoğu kısımlarını kapsayan geniş bir coğrafi alanda düşük frekanslarda yaygınlığını gösterdi. Suudi Arabistan geniş çapta İran, Pakistan, Hindistan, Nepal, Bangladeş ve Myanmar.[1]

Metspalu'nun çalışması, M18'in uzaysal dağılımının, Pencap Pakistan, Pencap, Hindistan, Rajasthan ve büyük bir kısmı boyunca Andhra Pradesh (Bkz M18 paneli [1] ).

M18 nodal haplotipin yüksek insidansı (% 33) Austroasiatic -konuşuyorum Lodha Batı Bengal'in bu popülasyonda olası bir kurucu etkisi olduğunu öne sürdü.[1] Ayrıca Metspalu'nun çalışmasında kabile verileri ile ve bu veriler olmadan hesaplanan bu küme için birleşme tahminleri arasındaki neredeyse iki kat farkı açıkladı.[1]

Yoğun bir genetik sürüklenme (özellikle kurucu etkiler) birleşme süresi hesaplamasına bir önyargı getirebileceğinden, bu nedenle Metspalu ve arkadaşları, Lodha örneği ile ve onsuz haplogrup M18'in birleşme süresini hesapladı ve 9,400 ± 3,200 ybp olarak buldu ve Sırasıyla 17.100 ± 4.700 ybp.[1] Thangaraj ve diğerleri, Haplogroup M18'in birleşmesinin 20.800 ± 8900 ybp olduğunu tahmin ediyor (Thangaraj ve diğerleri., 2006).[2]

Özetlemek gerekirse, Haplogroup M18 bireyleri

  • Suudi Arabistan
  • İran
  • Afganistan
  • Pakistan
  • Hindistan
  • Nepal
  • Butan
  • Çin
  • Bangladeş
  • Myanmar

Hindistan'da Dağıtım

Nispeten yüksek bir M18 haplogrup sıklığı gözlendi Pardhan Andhra Pradesh'in içinde tamamen yokken Naikpod Gond ve Andh (Thanseem ve diğerleri., 2006).[2] M18 bulundu Brahminler nın-nin Uttar Pradesh (Güneş ve diğerleri., 2006), Desasth Brahmin nın-nin Maharashtra (Gaikwad ve Kashyap, 2005), Khandayatlar of Orissa (Sahoo ve Kashyap, 2006) ve Oraon Bihar'dan (Thangaraj ve diğerleri., 2006).[2]

Chandrasekar A ve Raghavendra Rao ve diğerleri, Haplogroup M18'in monofiletik kökenini doğruladı ve yüksek sıklıkta ortaya çıktığını buldu. Mal Paharia halkı (numune büyüklüğünün% 29'unda).[5]

Metspalu ve diğerleri tarafından yapılan çalışmada, Haplogroup M18'i Andhra Pradesh ve Tamil Nadu'nun güneydoğu kesiminde buldu, ancak komşu Karnataka ve Kerala'da tamamen yok. Olası bir açıklama, Umman Denizi ve Bengal Körfezi kıyıları boyunca karışımın kolaylaştırılmasıdır.[1] Bununla birlikte, bu haplogrubun mutlak frekansı oldukça düşük olduğundan, numune büyüklüğündeki bir artışın gözlemlenen yayılma modelini bozacağı göz ardı edilemez.[1]

Referanslar

  1. ^ a b c d e f g h ben j Metspalu, Mait; Kivisild, Toomas; Metspalu, Ene; Parik, Jüri; Hudjashov, Georgi; Kaldma, Katrin; Serk, Piia; Karmin, Monika; Behar, Doron M; Gilbert, M Thomas P; Endicott, Phillip; Mastana, Sarabjit; Papiha, Surinder S; Skorecki, Karl; Torroni, Antonio; Villems Richard (2004). "Güney ve Güneybatı Asya'daki mevcut mtDNA sınırlarının çoğu, muhtemelen anatomik olarak modern insanlar tarafından Avrasya'nın ilk yerleşimi sırasında şekillendi". BMC Genetik. 5: 26. doi:10.1186/1471-2156-5-26. PMC  516768. PMID  15339343.
  2. ^ a b c d e f g h Maji, S; Krithika, S; Vasulu, TS (Nisan 2009). "Hindistan'da mitokondriyal DNA makrohaplogrup M'nin filocoğrafik dağılımı" (PDF). Genetik Dergisi. 88 (1): 127–39. doi:10.1007 / s12041-009-0020-3. PMID  19417557. S2CID  28080968.
  3. ^ a b c d Thangaraj, Kumarasamy; Chaubey, Gyaneshwer; Singh, Vijay; Vanniarajan, Ayyasamy; Saygı, İsmail; Reddy, Alla G; Singh, Lalji (2006). "Hindistan'daki mitokondriyal Macrohaplogroup 'M' köklerinin köklü köklerinin yerinde kökeni". BMC Genomics. 7: 151. doi:10.1186/1471-2164-7-151. PMC  1534032. PMID  16776823.
  4. ^ Güneş, Chang; Kong, Qing-Peng; Palanichamy, Malliya gounder; Agrawal, Suraksha; Bandelt, Hans-Jürgen; Yao, Yong-Gang; Khan, Faysal; Zhu, Chun-Ling; et al. (2005). "Tam Genomlardan Çıkarıldığı Şekilde Hindistan'dan M mtDNA Makrohaplogrup M'deki Bazal Dalların Göz Kamaştırıcı Dizisi". Moleküler Biyoloji ve Evrim. 23 (3): 683–90. doi:10.1093 / molbev / msj078. PMID  16361303.
  5. ^ A, Çandrasekar; ark., et; Sreenath, Jwalapuram; Sarkar, Bishwa Nath; Urade, Bhaskar Pralhad; Mallick, Sujit; Bandopadhyay, Syam Sundar; Barua, Pinuma; Barik, Subihra Sankar; Basu, Debasish; Kiran, Uttaravalli; Gangopadhyay, Prodyot; Sahani, Ramesh; Prasad, Bhagavatula Venkata Ravi; Gangopadhyay, Shampa; Lakshmi, Gandikota Rama; Ravuri, Rajasekhara Reddy; Padmaja, Koneru; Venugopal, Pulamaghatta N .; Sharma, Madhu Bala; Rao, Vadlamudi Raghavendra (2009). "Hindistan'da Mitokondriyal DNA Makrohaplogrup M'nin Filogenisinin Güncellenmesi: Modern İnsanın Güney Asya Koridorunda Dağılımı". PLOS ONE. 4 (10): e7447. Bibcode:2009PLoSO ... 4.7447C. doi:10.1371 / journal.pone.0007447. PMC  2757894. PMID  19823670.