Hin rekombinaz - Hin recombinase

Hin rekombinaz 21kD'dir protein 198'den oluşur amino asitler bakteride bulunan Salmonella. Hin aittir serin rekombinaz ailesi (B2) DNA invertazları güveniyor ki aktif site serin DNA bölünmesini ve rekombinasyonunu başlatmak için. İlgili protein, gama delta çözünürlüğü DNA'ya bağlı yapılar da dahil olmak üzere pek çok yapısal çalışma yapılmış olan Hin ile yüksek benzerliği paylaşır ve reaksiyon ara ürünleri. Hin 900 baz çiftini (bp Salmonella içindeki DNA segmenti genetik şifre içeren organizatör için akıntı yönünde kamçı genler, fljA ve fljB. Araya giren DNA'nın ters çevrilmesi, destekleyicinin yönünü değiştirir ve bu nedenle, ifade flagellar genlerin. Bu, bakteri için bir kaçış yolu olarak avantajlıdır. ev sahibi bağışıklık tepkisi.

Hin, iki 26bp kusurlu ters çevrilmiş tekrar dizisine bir homodimer. Bu hin bağlanma bölgeleri, sadece Hin geninin kendisini kodlayan değil, aynı zamanda bakteriyelin Fis proteinler nanomolar afinite ile bağlanır. Dört Fis molekülü bu bölgeye bir homodimerler olarak bağlanır ve rekombinasyon reaksiyonunun ilerlemesi için gereklidir.

İlk reaksiyon, Hin ve Fis'in ilgili DNA sekanslarına bağlanmasını ve daha yüksek bir sırada birleştirilmesini gerektirir. nükleoprotein dallanmış plectonemic ile kompleks süper bobinler DNA bükme proteini HU yardımı ile. Bu noktada, Fis proteininin, muhtemelen Hin proteini ile doğrudan etkileşimler yoluyla reaksiyonu etkinleştirmek için ince temasları modüle ettiğine inanılmaktadır. Hin içindeki 4 katalitik serin kalıntısının aktivasyonu tetramer 2-bp çift sarmallı bir DNA kırılması yapar ve bir kovalent reaksiyon ara ürünü oluşturur. DNA parçalanma olayı ayrıca iki değerli metali gerektirir. katyon magnezyum. Geniş bir konformasyonel değişim büyük bir hidrofobik protein-DNA kompleksi içinde süperhelikal torsiyonla tahrik edilebilen alt birim rotasyonuna izin veren arayüz. Bu 180 ° dönüşten sonra Hin doğal konformasyonuna geri döner ve bölünmüş DNA'yı yüksek enerjili kofaktörlerin yardımı olmadan ve herhangi bir DNA kaybı olmadan yeniden bağlar.

Referanslar

• Dhar G, Sanders E, Johnson R (2004). "Rekombinasyon sırasında hin sinaptik kompleksinin mimarisi: rekombinaz alt birimleri DNA zincirleri ile yer değiştirir". Hücre. 119 (1): 33–45. doi:10.1016 / j.cell.2004.09.010. PMID  15454079.
• Sanders E, Johnson R (2004). "Hin-katalizli rekombinasyon reaksiyonunun sinapsisten çözülmeye kadar aşamalı diseksiyonu". J Mol Biol. 340 (4): 753–66. doi:10.1016 / j.jmb.2004.05.027. PMID  15223318.
• Kamtekar S, Ho R, Cocco M, Li W, Wenwieser S, Boocock M, Grindley N, Steitz T (2006). "Gama delta resolvazın sinaptik tetramerlerinin yapılarının rekombinasyon mekanizması için etkileri". Proc Natl Acad Sci ABD. 103 (28): 10642–7. Bibcode:2006PNAS..10310642K. doi:10.1073 / pnas.0604062103. PMC  1483221. PMID  16807292.
• Li W, Kamtekar S, Xiong Y, Sarkis G, Grindley N, Steitz T (2005). "İki bölünmüş DNA'ya kovalent olarak bağlanmış bir sinaptik gammadelta resolvase tetramerinin yapısı". Bilim. 309 (5738): 1210–5. Bibcode:2005Sci ... 309.1210L. doi:10.1126 / science.1112064. PMID  15994378.