L27 alanı - L27 domain

L27 alanı
PDB 1rso EBI.jpg
Presinaptik protein SAP97'nin yapısı.[1]
Tanımlayıcılar
SembolL27
PfamPF02828
InterProIPR014775
L27_1
PDB 1rso EBI.jpg
hetero-tetramerik l27 (lin-2, lin-7) alan kompleksleri, supra-moleküler meclislerin organizasyon platformları olarak
Tanımlayıcılar
SembolL27_1
PfamPF09058
InterProIPR015143
L27_2
PDB 1vf6 EBI.jpg
Pals-1-l27n ve patj l27 heterodimer kompleksinin 2.1 angstrom kristal yapısı
Tanımlayıcılar
SembolL27_2
PfamPF09045
InterProIPR015132
L27_N
PDB 1vf6 EBI.jpg
Pals-1-l27n ve patj l27 heterodimer kompleksinin 2.1 angstrom kristal yapısı
Tanımlayıcılar
SembolL27_N
PfamPF09060
InterProIPR015145

L27 alanı bir protein alanı reseptör hedefleyen proteinlerde bulunan Lin-2 ve Lin-7 (LIN7A, LIN7B, LIN7C ) yanı sıra bazıları protein kinazlar ve insan MPP2 protein.[2] L27 alanı bir protein etkileşimi Büyük bir iskele proteinleri ailesinde bulunan modül, kurulması ve bakımı için gerekli olan büyük protein topluluklarının bir organizasyon merkezi olarak işlev görür. hücre polarite. L27 alanları belirli formlar heterotetramerik her alanın üç içerdiği kompleksler alfa sarmalları.[1]L27_2 alanı bir protein-protein etkileşimi organize edebilen alan iskele proteinleri oluşumu ile supramoleküler meclislere heteromerik L27_2 alan kompleksleri. L27_2 etki alanı aracılı protein meclislerin önemli roller oynadığı görülmüştür. hücresel dahil süreçler asimetrik hücre bölünmesi kurulması ve bakımı hücre polaritesi ve kümelenmesi reseptörler ve iyon kanalları. Bu ailenin üyeleri, her bir alanın üç tane içerdiği spesifik heterotetramerik kompleksler oluşturur. alfa sarmalları. İki N terminali Helisler her bir L27_2 etki alanı paketinin içinde sıkı, dört sarmallı bir paket oluşturmak için heterodimer üçüncü iken sarmal Her bir L27_2 alan adının, iki birimini bir araya getiren başka bir dört sarmallı heterodimer içine tetramer.[3]

L27_N alanı, genellikle L27 alanının N-terminalinde bulunur. Bir rol oynar biyogenez nın-nin sıkı kavşaklar ve hücre kutupluluğunun kurulmasında epitel hücreleri. Her L27_N alanı, ilk ikisi bir tane oluşturan üç alfa sarmalından oluşur. antiparalel sarmal bobin. İki L27 etki alanları ilk ikisinin oluşturduğu antiparalel sarmal bobinlerle dört sarmal bir demet oluşturmak için bir araya gelin Helisler. Üçüncü sarmal her bir alanın, dört sarmallı demetin bir ucunda başka bir sarmal bobin paketi oluşturarak büyük bir hidrofobik arayüz: hidrofobik etkileşimler harekete geçiren en büyük güçtür heterodimer oluşumu.[4]

Referanslar

  1. ^ a b Feng W, Long JF, Fan JS, Suetake T, Zhang M (Mayıs 2004). "Supramoleküler montajlar için bir organizasyon platformu olarak tetramerik L27 alan kompleksi" (PDF). Nat. Struct. Mol. Biol. 11 (5): 475–80. doi:10.1038 / nsmb751. PMID  15048107. S2CID  234860.
  2. ^ Doerks T, Bork P, Kamberov E, Makarova O, Muecke S, Margolis B (Temmuz 2000). "L27, Lin-2 ve Lin-7 proteinlerini hedefleyen reseptörde yeni bir heterodimerizasyon alanı". Trends Biochem. Sci. 25 (7): 317–8. doi:10.1016 / s0968-0004 (00) 01599-1. PMID  10871881.
  3. ^ Feng W, Long JF, Zhang M (Mayıs 2005). "MLin-2 / mLin-7 ve Patj / Pals1 iskele proteinlerinin oluşturduğu tetramerik L27 alan komplekslerinin yapıları tarafından ortaya çıkan birleşik bir montaj modu". Proc. Natl. Acad. Sci. AMERİKA BİRLEŞİK DEVLETLERİ. 102 (19): 6861–6. doi:10.1073 / pnas.0409346102. PMC  1100767. PMID  15863617.
  4. ^ Li Y, Karnak D, Demeler B, Margolis B, Lavie A (Temmuz 2004). "Sinyalleşme ve hücre polarite komplekslerinin L27 alanı aracılı montajı için yapısal temel". EMBO J. 23 (14): 2723–33. doi:10.1038 / sj.emboj.7600294. PMC  514954. PMID  15241471.

daha fazla okuma

Bu makale kamu malı metinleri içermektedir Pfam ve InterPro: IPR014775
Bu makale kamu malı metinleri içermektedir Pfam ve InterPro: IPR015143
Bu makale kamu malı metinleri içermektedir Pfam ve InterPro: IPR015132
Bu makale kamu malı metinleri içermektedir Pfam ve InterPro: IPR015145