Sema alanı - Sema domain
 Sema alanı, immünoglobulin alanı (Ig), kısa temel alan | |||||||||
| Tanımlayıcılar | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Sembol | Sema | ||||||||
| Pfam | PF01403 | ||||||||
| InterPro | IPR001627 | ||||||||
| PROSITE | PDOC51004 | ||||||||
| SCOP2 | 1olz / Dürbün / SUPFAM | ||||||||
| Membranom | 71 | ||||||||
| |||||||||
Sema alanı bir yapısal alan nın-nin semaforinler büyük olan aile salgılanan ve zar-ötesi proteinlerin bir kısmı itici sinyaller olarak işlev görür. akson rehberliği. Sema alanları ayrıca hepatosit büyüme faktörü reseptöründe meydana gelir (Uniprot: P08581), Pleksi A3 [1] (Uniprot: P51805) ve viral proteinlerde.
CD100 (olarak da adlandırılır SEMA4D) ile ilişkilidir PTPase ve serin kinaz aktivite. CD100, PMA, CD3 ve CD2 kaynaklı T hücre proliferasyonunu artırır, CD45 indüklü T hücresi yapışmasını artırır, B hücresi homotipik adezyonunu indükler ve aşağı regüle eder B hücresi ifadesi CD23.
Sema alanı, yapıyı stabilize etmek için dört disülfür bağı oluşturan korunmuş bir sistein tortusu seti ile karakterize edilir. Sema alanı katlama, merkezi bir eksen etrafında radyal olarak düzenlenmiş yedi kanatlı beta pervane topolojisinin bir varyasyonudur. Her bıçak, dört sarmallı (sarmal A'dan D'ye kadar) bir antiparalel beta yaprağı içerir. Her kanadın (A) iç ipi kanalı, aynı tekrardaki B ve C ipleri dışa doğru yayılan ve bir sonraki tekrarın D ipi kanadın dış kenarını oluşturacak şekilde pervanenin merkezinde hizalar. Sema alanının büyük boyutu, tek bir eklenen alan nedeniyle değildir, ancak kanatların çoğuna eklenen ek ikincil yapı elemanlarının varlığından kaynaklanmaktadır. Sema alanı, ilk ve son kanat arasındaki daireyi kapatmak için bir 'döngü ve kanca' sistemi kullanır. Kanatlar, yedinci (C-terminal) kanadın en dıştaki ipliğini (D) sağlayarak daireyi kapatan bir N terminal beta ipliği ile sırayla inşa edilir. Beta pervane, N-terminalinin bir uzantısı ile daha da stabilize edilerek, kanadın (6) dış kenarında ilave bir beşinci beta-ipliği sağlar.[2][3][4]
Bu alanı içeren insan proteinleri
TANIŞMAK; MST1R; PLXNA1; PLXNA2; PLXNA3; PLXNA4; PLXNB1; PLXNB2;PLXNB3; PLXND1; SEMA3A; SEMA3B; SEMA3C; SEMA3D; SEMA3E; SEMA3F;SEMA3G; SEMA4A; SEMA4B; SEMA4C; SEMA4D; SEMA4F; SEMA4G; SEMA5A;SEMA5B; SEMA6A; SEMA6B; SEMA6C; SEMA6D; SEMA7A;
Referanslar
- ^ Winberg ML, Noordermeer JN, Tamagnone L, Comoglio PM, Spriggs MK, Tessier-Lavigne M, Goodman CS (Aralık 1998). "Pleksin A, akson rehberliğini kontrol eden bir nöronal semaforin reseptörüdür". Hücre. 95 (7): 903–16. doi:10.1016 / S0092-8674 (00) 81715-8. PMID 9875845. S2CID 14703056.
- ^ Antipenko A, Himanen JP, van Leyen K, Nardi-Dei V, Lesniak J, Barton WA, Rajashankar KR, Lu M, Hoemme C, Püschel AW, Nikolov DB (Ağustos 2003). "Semaforin-3A reseptör bağlanma modülünün yapısı". Nöron. 39 (4): 589–98. doi:10.1016 / S0896-6273 (03) 00502-6. PMID 12925274. S2CID 9782923.
- ^ Love CA, Harlos K, Mavaddat N, Davis SJ, Stuart DI, Jones EY, Esnouf RM (Ekim 2003). "Semaforinlerin ligand bağlama yüzü, SEMA4D'nin yüksek çözünürlüklü kristal yapısı tarafından ortaya çıkarıldı". Doğa Yapısal Biyoloji. 10 (10): 843–8. doi:10.1038 / nsb977. PMID 12958590. S2CID 24468463.
- ^ Stamos J, Lazarus RA, Yao X, Kirchhofer D, Wiesmann C (Haziran 2004). "Met reseptörünün Sema alanı ile kompleks halindeki HGF beta zincirinin kristal yapısı". EMBO Dergisi. 23 (12): 2325–35. doi:10.1038 / sj.emboj.7600243. PMC 423285. PMID 15167892.