Küçük Cajal gövdesine özgü RNA 14 - Small Cajal body specific RNA 14

Küçük Cajal gövdesine özgü RNA 14
RF00582.jpg
Tahmin edilen ikincil yapı ve dizi koruma SCARNA14
Tanımlayıcılar
SembolSCARNA14
Alt. SembollersnoU100
RfamRF00582
Diğer veri
RNA tipGen; snRNA; snoRNA; scaRNA
Alan (lar)Ökaryota
GİTGO terimi GO ile başlamalıdır: GO terimi GO ile başlamalıdır: GO terimi GO ile başlamalıdır:
YANİİşletim Sistemi: 0000275
PDB yapılarPDBe

İçinde moleküler Biyoloji, Küçük Cajal gövdesine özgü RNA 14 (Ayrıca şöyle bilinir scaRNA14 veya U100) bir küçük nükleolar RNA içinde bulunan Cajal organları.

scaRNA'lar belirli bir sınıftır küçük nükleolar RNA'lar hangi yerelleştirilir Cajal organları ve değiştirilmesine rehberlik etmek RNA polimeraz II kopyalanmış spliceozomal RNA'lar U1, U2, U4, U5 ve U12.[1][2]U100, öngörülen firkete-menteşe-firkete-kuyruk yapısına ve korunmuş H / ACA-kutu motiflerine sahip olduğundan, H / ACA kutu kılavuz RNA sınıfına aittir.[3]

U100 insandır ortolog aynı zamanda bu aileye dahil olan fare H / ACA snoRNA MBII-201.[4]U100'ün U2'nin psödoüridilasyonuna rehberlik etmesi öngörülmektedir snRNA U7 kalıntısında.[5]

Referanslar

  1. ^ Darzacq X, Jády BE, Verheggen C, Kiss AM, Bertrand E, Kiss T (Haziran 2002). "Cajal vücuda özgü küçük nükleer RNA'lar: yeni bir 2'-O-metilasyon sınıfı ve psödoüridilasyon kılavuz RNA'lar". EMBO Dergisi. 21 (11): 2746–56. doi:10.1093 / emboj / 21.11.2746. PMC  126017. PMID  12032087.
  2. ^ Lestrade L, Weber MJ (Ocak 2006). "snoRNA-LBME-db, insan H / ACA ve C / D kutusu snoRNA'larının kapsamlı bir veritabanı". Nükleik Asit Araştırması. 34 (Veritabanı sorunu): D158-62. CiteSeerX  10.1.1.105.7552. doi:10.1093 / nar / gkj002. PMC  1347365. PMID  16381836.
  3. ^ Vitali P, Royo H, Seitz H, Bachellerie JP, Hüttenhofer A, Cavaillé J (Kasım 2003). "13 yeni insan modifikasyon kılavuzu RNA'sının tanımlanması". Nükleik Asit Araştırması. 31 (22): 6543–51. doi:10.1093 / nar / gkg849. PMC  275545. PMID  14602913.
  4. ^ Hüttenhofer A, Kiefmann M, Meier-Ewert S, O'Brien J, Lehrach H, Bachellerie JP, Brosius J (Haziran 2001). "RNomics: farede yeni, küçük, haberci olmayan RNA'lar için 201 aday belirleyen deneysel bir yaklaşım". EMBO Dergisi. 20 (11): 2943–53. doi:10.1093 / emboj / 20.11.2943. PMC  125495. PMID  11387227.
  5. ^ Schattner P, Barberan-Soler S, Lowe TM (Ocak 2006). "Memeli psödooridilasyon kılavuzu H / ACA RNA'ları için hesaplamalı bir ekran". RNA. 12 (1): 15–25. doi:10.1261 / rna.2210406. PMC  1370881. PMID  16373490.

Dış bağlantılar