TRIM3 - TRIM3

TRIM3
Tanımlayıcılar
Takma adlar	TRIM3, BERP, HAC1, RNF22, RNF97, 3 içeren üçlü motif
Harici kimlikler	OMIM: 605493 MGI: 1860040 HomoloGene: 21290 GeneCard'lar: TRIM3
Gen konumu (İnsan)
Chr.	Kromozom 11 (insan)
Son	6,474,459 bp
Gen konumu (Fare)
Chr.	Kromozom 7 (fare)
Son	105,633,571 bp
RNA ifadesi Desen
	; ; ; ;
	Daha fazla referans ifade verisi
Gen ontolojisi
Moleküler fonksiyon	• çinko iyonu bağlama; • protein C-terminal bağlanması; • GO: 0001948 protein bağlama; • metal iyon bağlama; • GO: 1904264, GO: 1904822, GO: 0090622, GO: 0090302 ubiquitin protein ligaz aktivitesi; • ubikitin-protein transferaz aktivitesi;
Hücresel bileşen	• sitoplazma; • endozom; • erken endozom; • hücre içi; • Golgi cihazı; • dendrit; • hücre projeksiyonu;
Biyolojik süreç	• protein taşınması; • proteinin aynı anda bulunması; • sinir sistemi gelişimi; • protein poliubikitinasyonu; • proteazom aracılı ubikuitin bağımlı protein katabolik süreç;
	Kaynaklar:Amigo / QuickGO
Ortologlar
	10612
	55992
	ENSG00000110171
	ENSMUSG00000036989
	O75382
	Q9R1R2
	NM_001248006; NM_001248007; NM_006458; NM_033278
	NM_001285870; NM_001285871; NM_001285873; NM_018880; NM_001360425
	NP_001234935; NP_001234936; NP_006449; NP_150594
	NP_001272799; NP_001272800; NP_001272802; NP_061368; NP_001347354
	Vikiveri
İnsanı Görüntüle / Düzenle	Fareyi Görüntüle / Düzenle

Üçlü motif içeren protein 3 bir protein insanlarda kodlanır TRIM3 gen.^[5]^[6]

Bu gen tarafından kodlanan protein, RING parmak proteinlerinin 'RING-B-box-sarmal-sarmal' (RBCC) alt grubu olarak da adlandırılan üçlü motif (TRIM) ailesinin bir üyesidir. TRIM motifi, üç çinko bağlama alanı, bir HALKA, bir B-kutusu tip 1 ve bir B-kutusu tip 2 ve bir sarmal sargı bölgesi içerir. Bu protein, sitoplazmik filamentlere yerleşir. Organellerin hedeflenen taşınmasında rol oynayan miyozinlerin bir sınıfı olan miyosin V'in kuyruk bölgesi için spesifik bir ortak olan sıçan proteinine benzer. Sıçan proteini ayrıca alfa-aktin-4 ile etkileşime girebilir. Bu nedenle, bu insan proteininin miyozin V aracılı kargo taşımacılığında bir rol oynayabileceği öne sürülmektedir. Aynı izoformu kodlayan alternatif olarak uç uca eklenmiş transkript varyantları tanımlanmıştır.^[6]

Etkileşimler

TRIM3'ün gösterdiği etkileşim ile Actinin alpha 4.^[7]

Referanslar

^ ^a ^b ^c GRCh38: Ensembl sürümü 89: ENSG00000110171 - Topluluk, Mayıs 2017
^ ^a ^b ^c GRCm38: Topluluk sürümü 89: ENSMUSG00000036989 - Topluluk, Mayıs 2017
^ "İnsan PubMed Referansı:". Ulusal Biyoteknoloji Bilgi Merkezi, ABD Ulusal Tıp Kütüphanesi.
^ "Mouse PubMed Referansı:". Ulusal Biyoteknoloji Bilgi Merkezi, ABD Ulusal Tıp Kütüphanesi.
^ El-Husseini AE, Vincent SR (Temmuz 1999). "Sınıf V miyozinlerle etkileşime giren yeni bir RING parmak proteininin klonlanması ve karakterizasyonu". Biyolojik Kimya Dergisi. 274 (28): 19771–7. doi:10.1074 / jbc.274.28.19771. PMID 10391919.
^ ^a ^b "Entrez Gene: TRIM3 üçlü motif içeren 3".
^ El-Husseini AE, Kwasnicka D, Yamada T, Hirohashi S, Vincent SR (Ocak 2000). "Yeni bir yüzük parmağı proteini olan BERP, alfa-aktin-4'e bağlanır". Biyokimyasal ve Biyofiziksel Araştırma İletişimi. 267 (3): 906–11. doi:10.1006 / bbrc.1999.2045. PMID 10673389.

daha fazla okuma

El-Husseini AE, Kwasnicka D, Yamada T, Hirohashi S, Vincent SR (Ocak 2000). "Yeni bir yüzük parmağı proteini olan BERP, alfa-aktin-4'e bağlanır". Biyokimyasal ve Biyofiziksel Araştırma İletişimi. 267 (3): 906–11. doi:10.1006 / bbrc.1999.2045. PMID 10673389.
El-Husseini AE, Fretier P, Vincent SR (Şubat 2001). "İnsan kromozomu 11p15.5 ile eşleşen yeni bir beyinde ifade edilen halka parmağı proteinini (BERP) kodlayan bir genin (RNF22) klonlanması ve karakterizasyonu". Genomik. 71 (3): 363–7. doi:10.1006 / geno.2000.6452. PMID 11170753.
Reymond A, Meroni G, Fantozzi A, Merla G, Cairo S, Luzi L, Riganelli D, Zanaria E, Messali S, Cainarca S, Guffanti A, Minucci S, Pelicci PG, Ballabio A (Mayıs 2001). "Üçlü motif ailesi hücre bölmelerini tanımlar". EMBO Dergisi. 20 (9): 2140–51. doi:10.1093 / emboj / 20.9.2140. PMC 125245. PMID 11331580.
Lee SJ, Choi JY, Sung YM, Park H, Rhim H, Kang S (Ağustos 2001). "Bir insan ubikitin-konjüge edici enzim olan Hip-2 ile etkileşime giren RING parmak proteinlerinin E3 ligaz aktivitesi". FEBS Mektupları. 503 (1): 61–4. doi:10.1016 / S0014-5793 (01) 02689-8. PMID 11513855. S2CID 42977319.
Yan Q, Sun W, Kujala P, Lotfi Y, Vida TA, Bean AJ (Mayıs 2005). "CART: verimli reseptör geri dönüşümü için gerekli bir Hrs / actinin-4 / BERP / miyosin V protein kompleksi". Hücrenin moleküler biyolojisi. 16 (5): 2470–82. doi:10.1091 / mbc.E04-11-1014. PMC 1087250. PMID 15772161.
Olsen JV, Blagoev B, Gnad F, Macek B, Kumar C, Mortensen P, Mann M (Kasım 2006). "Sinyal ağlarında küresel, in vivo ve bölgeye özgü fosforilasyon dinamikleri". Hücre. 127 (3): 635–48. doi:10.1016 / j.cell.2006.09.026. PMID 17081983. S2CID 7827573.

Bu makale bir gen açık insan kromozomu 11 bir Taslak. Wikipedia'ya şu yolla yardım edebilirsiniz: genişletmek.

[refGRCh38Ensembl-1] GRCh38: Ensembl sürümü 89: ENSG00000110171 - Topluluk, Mayıs 2017

[refGRCm38Ensembl-2] GRCm38: Topluluk sürümü 89: ENSMUSG00000036989 - Topluluk, Mayıs 2017

[3] "İnsan PubMed Referansı:". Ulusal Biyoteknoloji Bilgi Merkezi, ABD Ulusal Tıp Kütüphanesi.

[4] "Mouse PubMed Referansı:". Ulusal Biyoteknoloji Bilgi Merkezi, ABD Ulusal Tıp Kütüphanesi.

[pmid10391919-5] El-Husseini AE, Vincent SR (Temmuz 1999). "Sınıf V miyozinlerle etkileşime giren yeni bir RING parmak proteininin klonlanması ve karakterizasyonu". Biyolojik Kimya Dergisi. 274 (28): 19771–7. doi:10.1074 / jbc.274.28.19771. PMID 10391919.

[entrez-6] "Entrez Gene: TRIM3 üçlü motif içeren 3".

[pmid10673389-7] El-Husseini AE, Kwasnicka D, Yamada T, Hirohashi S, Vincent SR (Ocak 2000). "Yeni bir yüzük parmağı proteini olan BERP, alfa-aktin-4'e bağlanır". Biyokimyasal ve Biyofiziksel Araştırma İletişimi. 267 (3): 906–11. doi:10.1006 / bbrc.1999.2045. PMID 10673389.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]