Mutanome - Mutanome

mutanom somatiğin bütünlüğü kanser mutasyonlar bireysel bir tümörde.[1]

Açıklama

Karsinojenez büyük ölçüde DNA dizisi genomlar kanser hücrelerinin.[1][2] Bu süreç, her hastanın tümöründe benzersiz bir mutasyon repertuarına (′ mutanom ′) yol açar.[3][4] Mutanom, hedef olabilecek peptitleri kodlar. T hücreleri bağışıklık tepkisinde merkezi bir rol oynayan.[5]

İnsan tümörlerinin münferit mutanomlarının bir açıklaması, Yeni nesil sıralama Teknoloji (NGS).[6] Kanser mutanomları karşılaştırılarak tanımlanabilir ekzom Tümör kaynaklı dizilerle bireysel sağlıklı dokunun NGS'si ile elde edilen sıralama verileri nükleik asitler.[7] Kanserle ilişkili mutasyonların büyük çoğunluğu hastaya özgü olduğundan, paylaşılan mutasyonlar aynı kanser türünde bile nadirdir.[7][8][9]

Neoantijenler ve neoepitoplar

Mutanom, şu şekilde anılan tümöre özgü mutasyona uğramış peptitlerin bir modelini kodlar. neoantijenler veya m-peptidler. Neoantijenler, ilk olarak kanser gelişimi sırasında ortaya çıkan mutasyonların ürünleridir. Her tümörün kendine özgü neoantijenik paterni vardır ve aynı kanser türünde bile neoantijenlerin sadece küçük bir yüzdesi paylaşılır.[5][10]

Neoantijenler, temel doku uyumluluk kompleksi (MHC) tümör hücrelerinin molekülleri.[8][10][11] Neoantijenlerin antijenik belirleyicileri - neoepitoplar - bağışıklık sistemi tarafından T hücreleri için bir hedef olarak tanınır ve böylece kansere karşı bağışıklık tepkilerini tetikler.[1][12]

Bir neoepitop, bağışıklık sisteminin daha önce karşılaşmadığı bir epitoptur. Bu nedenle bağışıklık sisteminin tolerans mekanizmalarına tabi değildir.[13] Mutasyona uğramış gen ürünü sadece tümörlerde ifade edildiğinden, sağlıklı hücrelerde ifade edilmediğinden, neoepitoplar güçlü T hücresi tepkisi uyandırabilir.[6]

Mutanom immünoterapi

Kanser mutasyonlarının büyük çoğunluğu hastaya özeldir,[9] ve mutasyonların önemli bir kısmı (% 21-45) immünojeniktir.[1] Bu nedenle, hastaların bireysel mutanomu ve neoepitopları, kansere karşı yeni bir stratejinin temeli olarak kullanılır; kişiye özel kanser immünoterapisi.[14] Kanser immünoterapisi vücudun kendi bağışıklık savunma sistemini kullanır ve antitümör aktivitesi olan sitotoksik ve yardımcı T hücrelerinin tanınmasına dayanır.[10]

Mutanoma özgü aşılar

Bireysel mutanomu immünoterapötik olarak ele alma stratejileri şu anda araştırılmaktadır.[8][11][14][15] Devam eden mutanom kanser aşısı denemelerde sentetik peptidler ve antijen kodlama kullanılır DNA veya RNA formatlar olarak.[7] Bireyselleştirilmiş bir tedavi için, güçlü bir bağışıklık tepkisi ortaya çıkardığı düşünülen neoepitoplar, hastanın mutanomundan seçilir.[14][16]

Bireyselleştirilmiş kanser immünoterapisi için giderek daha fazla araştırılan bir kavram, immünojenik bir hastanın tedavisidir. mRNA aşıları belirli bir hastanın bireysel kanser mutanomu için (IVAC - Kansere Karşı Kişiselleştirilmiş Aşı).[14][16] IVAC kavramı, tek tek hastalarda kansere karşı terapötik aşılar üretmek için kullanılmak üzere bireysel mutanomun NGS ile kodunun çözülmesine ve isteğe bağlı mRNA üretimine dayanmaktadır.[8][14][15]

2016'dan beri IVAC konsepti şu şekilde geliştirildi: Kişiselleştirilmiş Neoantijene Özel Terapi (iNeST).

NSG tabanlı kanser mutanom haritalama süreci, hedef seçimi, önceliklendirme yaklaşımları, sentetik mRNA aşısı üretimi ve dağıtımı da şu şekilde adlandırılır: MERIT (mutanomla tasarlanmış RNA immünoterapisi).[8][17] Mutant bir tümör peptidinin planını içeren sentetik mRNA ile aşılama yoluyla, T lenfositleri tümöre karşı aktive edilir.[7][17]

Referanslar

  1. ^ a b c d Vormehr, M; Diken, M; Boegel, S; Kreiter, S; Türeci, Ö; Şahin, U (2016). "Mutanome yönlendirilmiş kanser immünoterapisi". İmmünolojide Güncel Görüş. 39: 14–22. doi:10.1016 / j.coi.2015.12.001. PMID  26716729.
  2. ^ Stratton, MR; Campbell, PJ; Futreal, PA (2009). "Kanser genomu". Doğa. 458 (7239): 719–24. Bibcode:2009Natur.458..719S. doi:10.1038 / nature07943. PMC  2821689. PMID  19360079.
  3. ^ Kreiter, S; Castle, JC; Türeci, Ö; Şahin, U (2012). "Kişiselleştirilmiş aşılama tedavisi için tümör mutanomunu hedefleme". Onkimmunoloji. 1 (5): 768–9. doi:10.4161 / onci.19727. PMC  3429589. PMID  22934277.
  4. ^ Stratton, MR (2011). "Kanser hücrelerinin genomlarını keşfetmek: ilerleme ve vaat". Bilim. 331 (6024): 1553–8. Bibcode:2011Sci ... 331.1553S. doi:10.1126 / science.1204040. PMID  21436442.
  5. ^ a b Overwijk, WW; Wang, E; Marincola, FM; Rammensee, HG; Restifo, NP (2013). "Mutanom madenciliği: tümörlerin mutasyonel analizine dayalı son derece kişiselleştirilmiş immünoterapiler geliştirmek". Kanser İmmünoterapi Dergisi. 1: 11. doi:10.1186/2051-1426-1-11. PMC  4019909. PMID  24829748.
  6. ^ a b Heemskerk, B; Kvistborg, P; Schumacher, TNM (2013). "Kanser antijenomu". EMBO Dergisi. 32 (2): 194–203. doi:10.1038 / emboj.2012.333. PMC  3553384. PMID  23258224.
  7. ^ a b c d Türeci, Ö; Vormehr, M; Diken, M; Kreiter, S; Huber, C; Şahin, U (2016). "Kişiselleştirilmiş Neoepitop Aşılarıyla Kanserin Heterojenliğini Hedefleme". Klinik Kanser Araştırmaları. 22 (8): 1885–96. doi:10.1158 / 1078-0432.CCR-15-1509. PMID  27084742.
  8. ^ a b c d e Castle, JC; Kreiter, S; Diekmann, J; Löwer, M; van de Roemer, N; de Graaf, J; Selmi, A; Diken, M; Boegel, S; Paret, C; Koslowski, M; Kuhn, AN; Britten, CM; Huber, C; Türeci, Ö; Şahin, U (2012). "Tümör aşılaması için mutanomu kullanmak". Kanser araştırması. 72 (5): 1081–91. doi:10.1158 / 0008-5472.CAN-11-3722. PMID  22237626.
  9. ^ a b Kreiter, S; Vormehr, M; van de Roemer, N; Diken, M; Löwer, M; Diekmann, J; Boegel, S; Schrörs, B; Vascotto, F; Castle, JC; Tadmor, AD; Schoenberger, SP; Huber, C; Türeci, Ö; Şahin, U (2015). "Mutant MHC sınıf II epitopları, kansere karşı terapötik bağışıklık tepkilerini yönlendirir". Doğa. 520 (7549): 692–6. Bibcode:2015Natur.520..692K. doi:10.1038 / nature14426. PMC  4838069. PMID  25901682.
  10. ^ a b c Vormehr, M; Schrörs, B; Boegel, S; Löwer, M; Türeci, Ö; Şahin, U (2015). "Mutanom Tasarımlı RNA İmmünoterapisi: Hasta Merkezli Tümör Aşılamasına Doğru". İmmünoloji Araştırmaları Dergisi. 2015: 595363. doi:10.1155/2015/595363. PMC  4710911. PMID  26844233.
  11. ^ a b Matsushita, H; Vesely, MD; Koboldt, DC; Rickert, CG; Uppaluri, R; Magrini, VJ; Arthur, CD; Beyaz, JM; Chen, YS; Shea, LK; Hundal, J; Wendl, MC; Demeter, R; Wylie, T; Allison, JP; Smyth, MJ; Eski, LJ; Mardis, ER; Schreiber, RD (2012). "Kanser ekzom analizi, T hücresine bağlı kanser immüno düzenleme mekanizmasını ortaya koyuyor". Doğa. 482 (7385): 400–4. Bibcode:2012Natur.482..400M. doi:10.1038 / nature10755. PMC  3874809. PMID  22318521.
  12. ^ Katsnelson, A (2016). "Mühimmat olarak mutasyonlar: Neoantijen aşıları kanser tedavisi olarak daha yakından bakılıyor". Doğa Tıbbı. 22 (2): 122–4. doi:10.1038 / nm0216-122. PMID  26845402.
  13. ^ Vormehr, M; Türeci, Ö; Şahin, U (2019). "Gerçekten Bireyselleştirilmiş Kanser Aşıları için Tümör Mutasyonlarından Yararlanma". Yıllık Tıp İncelemesi. 70: 395–407. doi:10.1146 / annurev-med-042617-101816. PMID  30691374.
  14. ^ a b c d e Şahin, U; Derhovanessian, E; Miller, M; Kloke, BP; Simon, P; Löwer, M; Bukur, V; Tadmor, AD; Luxemburger, U; Schrörs, B; Omokoko, T; Vormehr, M; Albrecht, C; Paruzynski, A; Kuhn, AN; Buck, J; Heesch, S; Schreeb, KH; Müller, F; Ortseifer, I; Vogler, I; Godehardt, E; Attig, S; Rae, R; Breitkreuz, A; Tolliver, C; Suchan, M; Martic, G; Hohberger, A; Sorn, P; Diekmann, J; Ciesla, J; Waksmann, O; Brück, AK; Witt, M; Zillgen, M; Rothermel, A; Kasemann, B; Langer, D; Bolte, S; Diken, M; Kreiter, S; Nemecek, R; Gebhardt, C; Grabbe, S; Höller, U; Utikal, J; Huber, C; Loquai, C; Türeci, Ö (2017). "Kişiselleştirilmiş RNA mutanom aşıları, kansere karşı poli-spesifik terapötik bağışıklığı harekete geçirir". Doğa. 547 (7662): 222–6. Bibcode:2017Natur.547..222S. doi:10.1038 / nature23003. PMID  28678784.
  15. ^ a b Hilf, N; Kuttruff-Coqui, S; Frenzel, K; Bukur, V; Stevanović, S; Gouttefangeas, C; Platten, M; Tabatabai, G; Dutoit, V; van der Burg, SH; Thor Straten, P; Martínez-Ricarte, F; Ponsati, B; Okada, H; Lassen, U; Admon, A; Ottensmeier, CH; Ülges, A; Kreiter, S; von Deimling, A; Skardelly, M; Migliorini, D; Kroep, JR; Idorn, M; Rodon, J; Piro, J; Poulsen, HS; Shraibman, B; McCann, K; Mendrzyk, R; Löwer, M; Stieglbauer, M; Britten, CM; Capper, D; Welters, MJP; Sahuquillo, J; Kiesel, K; Derhovanessian, E; Rusch, E; Bunse, L; Şarkı, C; Heesch, S; Wagner, C; Kemmer-Brück, A; Ludwig, J; Castle, JC; Schoor, O; Tadmor, AD; Yeşil, E; Fritsche, J; Meyer, M; Pawlowski, N; Dorner, S; Hoffgaard, F; Rössler, M; Maurer, C; Weinschenk, T; Reinhardt, C; Huber, C; Rammensee, HG; Singh-Jasuja, H; Şahin, U; Dietrich, PY; Wick, W (2019). "Yeni teşhis edilmiş glioblastoma için aktif olarak kişiselleştirilmiş aşı denemesi". Doğa. 565 (7738): 240–5. Bibcode:2019Natur.565..240H. doi:10.1038 / s41586-018-0810-y. PMID  30568303. S2CID  56480674.
  16. ^ a b Kranz, LM; Diken, M; Haas, H; Kreiter, S; Loquai, C; Reuter, KC; Meng, M; Fritz, D; Vascotto, F; Hefesha, H; Grunwitz, C; Vormehr, M; Hüsemann, Y; Selmi, A; Kuhn, AN; Buck, J; Derhovanessian, E; Rae, R; Attig, S; Diekmann, J; Jabulowsky, RA; Heesch, S; Hassel, J; Langguth, P; Grabbe, S; Huber, C; Türeci, Ö; Şahin, U (2016). "Dendritik hücrelere sistemik RNA iletimi, kanser immünoterapisi için antiviral savunmadan yararlanır". Doğa. 534 (7607): 396–401. Bibcode:2016Natur.534..396K. doi:10.1038 / nature18300. PMID  27281205.
  17. ^ a b Şahin, U; Karikó, K; Türeci, Ö (2014). "mRNA tabanlı terapötikler - yeni bir ilaç sınıfı geliştirme". Doğa İncelemeleri İlaç Keşfi. 13 (10): 759–80. doi:10.1038 / nrd4278. PMID  25233993. S2CID  27454546.

Dış bağlantılar